Sur l'île Météore, les agents secrets du Dino doivent retrouver Mister Flashy, un jeune vélociraptor blessé coincé au fond d'un trou. Au cours de leur mission, Geronimo et toute l'équipe découvrent des clairières habitées par de paisibles dinosaures, échappent à une charge de stégosaures et déjouent les plans de Boston Blake, un pirate prêt à tout pour s'approprier le trésor de l'île.